目前，全县共有各级各类医疗卫生计生机构150个（能提供中医药服务141个）。其中，县直医疗卫生计生单位5个（县人民医院、县中医医院、县卫生计生综合监督执法所、县妇幼保健计划生育服务中心、县疾病预防控制中心）、乡镇（中心）卫生院12个、社会办医医疗机构9个（民营医院4个：昌宁天和医院、昌宁仁爱医院、昌宁康弘精神专科医院、昌宁仁德医院；个体诊所5个：昌宁福慧诊所、昌宁众合口腔诊所、昌宁盛昌诊所、昌宁腾宏诊所、昌宁心和诊所）、托幼机构卫生保健室1个、村卫生所123所。在岗卫生专业技术人员1933人（中医药人员255人；县乡两级公立医院卫技人员编内676人、编外617人），其中，取得副高及其以上职称123人、中职198人、初职924人、未定职称461人，乡村医生340人。执业（助理）医师412人，从业护士734人，执业护士664人；编制床位2120张，实有床位1542张（中医330张）。每千人口拥有卫生技术人员和床位分别为6人和6张。